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PCR擴增曲線異常——斜直線型擴增曲線

更新時間:2024-07-18  |  點擊率:518

現(xiàn)象描述:

在進行PCR擴增時,發(fā)現(xiàn)部分樣本的擴增曲線呈現(xiàn)斜直線型,而非正常的平滑S型曲線。這種異常曲線表明PCR反應(yīng)可能存在問題,導(dǎo)致擴增效率不穩(wěn)定或擴增產(chǎn)物非特異性。

 

原因分析:

管蓋未蓋緊:由于每天處理的標本量較大,操作人員在加樣后可能未將PCR管蓋緊,導(dǎo)致在擴增過程中反應(yīng)液蒸發(fā),管內(nèi)體積減少。這不僅改變了讀取熒光的標準,還可能導(dǎo)致探針濃度增加,進而形成斜直線型擴增曲線。

耗材問題:使用的PCR反應(yīng)管或封膜質(zhì)量不佳,也可能導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)或熒光信號采集異常。例如,反應(yīng)管氣密性差、封膜不牢固等。

實驗操作不規(guī)范:如加樣時產(chǎn)生大量氣泡,氣泡在PCR過程中破裂會影響熒光信號的穩(wěn)定采集,導(dǎo)致擴增曲線異常。

 

解決方案:

嚴格操作規(guī)范:在進行PCR加樣時,務(wù)必確保PCR管蓋緊,并使用質(zhì)量合格、匹配度高的耗材。同時,加樣時要避免產(chǎn)生大氣泡,上機前注意彈掉氣泡并離心。

檢查耗材質(zhì)量:定期評估耗材的質(zhì)量,選擇品牌好、質(zhì)量可靠的PCR反應(yīng)管和封膜。如果發(fā)現(xiàn)耗材有問題,應(yīng)及時更換。

復(fù)查樣本:對于出現(xiàn)斜直線型擴增曲線的樣本,建議進行復(fù)查??梢灾匦绿崛『怂岵⒅匦逻M行PCR擴增,以排除實驗操作過程中的偶然因素。

優(yōu)化PCR條件:如果問題持續(xù)存在,可能需要調(diào)整PCR反應(yīng)條件,如退火溫度、循環(huán)次數(shù)等。通過梯度PCR等方法找到最佳的擴增條件。

 

通過這個實際案例可以看出,PCR結(jié)果不滿意的原因往往與實驗操作、耗材質(zhì)量、PCR條件等多方面因素有關(guān)。只有全面分析問題、找出原因并采取有效的解決方案,才能提高PCR的成功率和準確性。使用德國MB公司生產(chǎn)的PCR Clean核酸污染清除試劑,維護實驗室衛(wèi)生,可以幫助分子實驗達到更高的準確度。


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